Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms