Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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