Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms