Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms