Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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