Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PKD2L1Q9P0L9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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PKD2L1Q9P0L9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKD2L1Q9P0L9 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKD2L1Q9P0L9 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKD2L1Q9P0L9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKD2L1Q9P0L9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKD2L1Q9P0L9 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PKD2L1Q9P0L9 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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