Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
POLR2J2Q9GZM3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms