Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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