Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP13Q92995 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP13Q92995 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP13Q92995 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP13Q92995 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms