Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms