Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
DUX4L9Q6RFH8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms