Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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NBR1Q14596 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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NBR1Q14596 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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NBR1Q14596 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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