Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SIGLEC10-206ENST00000441969 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 FAM84A-202ENST00000331243 3765 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CEP83-203ENST00000397809 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DDX3P1-201ENST00000418231 1950 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC073578.3-201ENST00000624926 4191 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TYRO3-202ENST00000559066 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CHRNB1-208ENST00000576360 1837 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CECR3-201ENST00000428828 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MPP4-201ENST00000315506 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PSAPL1-201ENST00000319098 4680 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DUSP27-202ENST00000361200 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC27A6-202ENST00000395266 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms