Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 MIA-RAB4B-201ENST00000600729 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CACNA1BQ00975 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms