Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ERVS71-1P61550 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms