Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2FP61218 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms