Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms