Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms