Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL23P55773 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms