Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MLH1P40692 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms