Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COPB2P35606 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COPB2P35606 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms