Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCN4AP35499 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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