Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BRAFP15056 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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