Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms