Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms