Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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