Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KNCNA6PVL3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
KNCNA6PVL3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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