Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
A3GALT2U3KPV4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A3GALT2U3KPV4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms