Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPG1Q9Y678 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPG1Q9Y678 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms