Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC6Q9Y625 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPC6Q9Y625 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms