Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP16Q9Y5T5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP16Q9Y5T5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP16Q9Y5T5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms