Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms