Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TIMM9Q9Y5J7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMM9Q9Y5J7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms