Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB9Q9Y5E1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB9Q9Y5E1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms