Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP15Q9Y4E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP15Q9Y4E8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms