Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP3Q9Y446 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP3Q9Y446 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP3Q9Y446 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms