Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms