Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMED3Q9Y3Q3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED3Q9Y3Q3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED3Q9Y3Q3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms