Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXOSC1Q9Y3B2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC1Q9Y3B2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms