Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRELID3BQ9Y3B1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms