Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS2Q9Y248 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms