Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNEQ9Y223 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNEQ9Y223 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms