Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNQ9UQP3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNQ9UQP3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms