Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHOC2Q9UQ13 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHOC2Q9UQ13 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHOC2Q9UQ13 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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