Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAMD4AQ9UPU9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SAMD4AQ9UPU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms