Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG5Q9UPR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG5Q9UPR3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms