Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNRC6BQ9UPQ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms