Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ8

DOLK, Dolichol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOLKQ9UPQ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DOLKQ9UPQ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DOLKQ9UPQ8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms