Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFR2Q9UP52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFR2Q9UP52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFR2Q9UP52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms