Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSFL1CQ9UNZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSFL1CQ9UNZ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms