Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF18Q9UNG2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms